La dernière plus grosse déconvenue nous vient de 2006 avec les hommes de Duguépéroux qui se rendent chez les amateurs de Lyon-la-Duchère (CFA) et voient la qualification leur passer sous le nez dans un match insipide (0-0, 5-4tab).
Après un mois de décembre 2002 sans victoires, la bande à Ivan Hasek se rend du coté de Bourg-Peronnas pour son entrée dans la compétition. Un 32ème de finale qui sonnera également la fin de l’aventure puisque le seul but de la rencontre sera l’oeuvre de Jean-Christophe Durand à la 24ème minute (1-0).
En quart de finale de l’édition 2000 et après avoir éliminé le PSG, le Racing alors en D1, ne tient pas son rang et chute face à Calais, club de CFA (2-1). Quatre ans plus tôt mais toujours en D1 et en quart, Strasbourg se rend à Nîmes, alors en National. Malgré l’ouverture du score alsacienne, Eric Sabin en prolongation, donne la qualification aux crocos (3-2).
Bien sûr, d’autres sombres lignes dans cette compétition ont eu lieu, à eux d’en rajouter une nouvelle.